二者的主体不同
劳动关系的主体的一方必须是用人单位。即必须是在中华人民共和国境内的的各类企业、事业单位、社会团体和个体工商户，
而雇佣关系的主体的双方都是自然人。
二者所属法律部门不同
劳动关系属于劳动法和《劳动合同法》调整，是社会法的一个分支。
雇佣关系是一种民事关系，受民法和合同法的调整，是民法的一部分。
解决纠纷的途径不同
劳动关系中发生的纠纷首先要经过劳动仲裁委员会的仲裁，对仲裁不服的才能向法院起诉，实行仲裁前置程序。
雇佣关系是民事关系，发生纠纷后无需经过仲裁程序，可以直接向法院起诉。
如果劳动者在劳动受伤处理的程序也不同
如果是劳动关系的劳动者受伤，属于工伤，适用《工伤保险条例》的规定进行赔偿，而雇佣关系中发生伤亡则属于民法中的人身损害，适用《民法通则》、最高人民法院《关于适用民法通则若夫干问题的意见》、最高人民法院《关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》进行赔偿。
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